Sant Joan d’Isil está alejada del pueblo, como pasa a menudo en los valles de Àneu con las iglesias románicas. Es un edificio del siglo XII que parece responder a diferentes proyectos de obras y reformas. Actualmente podemos ver una construcción de planta basilical, de tres naves encaradas a levante per tres ábsides de estilo lombardo. Esta cabecera está construida sobre el cauce de la Noguera Pallaresa.
El muro meridional tiene una abundante decoración escultórica. Se encuentra la portada con tres arquivoltas de medio punto que, a ambos lados, presentan columnas con capitel esculpidos. Son remarcables también, bajo el alero de la cubierta, los relieves esculpidos por encima de las arcuaciones ajedrezadas. El alero queda interrumpido por la colocación, en un momento indeterminado, de dos estelas esculpidas parecidas a las de Sant Lliser de Alós de Isil.
Para acceder al cementerio y a la misma iglesia se tiene que pasar por un portal que mantiene las marcas que cada año se hacen la noche de Sant Juan con las Fallas encendidas.
